आगदतंत्र विभागामध्ये तीन प्रमुख विषयांचा समावेश होतो: आगदतंत्र (Toxicology), व्यवहार आयुर्वेद (Forensic Medicine) आणि विधिवैद्यक (Medical Jurisprudence).

आगदतंत्रामध्ये विविध प्रकारच्या विषांचा सविस्तर अभ्यास व त्यांचे व्यवस्थापन केले जाते. व्यवहार आयुर्वेदामध्ये वैद्यकीय क्षेत्राशी संबंधित कायदेशीर बाबींचा अभ्यास केला जातो, तर विधिवैद्यकात कायद्याच्या दृष्टीने वैद्यकीय विषयांचा अभ्यास केला जातो.

आगदतंत्र, व्यवहार आयुर्वेद आणि विधिवैद्यक विभाग (Toxicology, Forensic Medicine आणि Medical Jurisprudence) द्वितीय व तृतीय वर्षातील बी.ए.एम.एस. पदवीपूर्व विद्यार्थ्यांना तसेच पदव्युत्तर विद्यार्थ्यांना व्याख्याने, ई-व्याख्याने, प्रात्यक्षिके आणि शैक्षणिक भेटी यांच्या माध्यमातून शिक्षण प्रदान करतो.

या विभागामध्ये प्रशस्त जागेत शैक्षणिक विभाग (Academic Section) आणि संग्रहालय (Museum) उपलब्ध आहे. विभागामध्ये सुसज्ज संग्रहालय असून त्यामध्ये नमुने (specimens), चार्ट्स आणि मॉडेल्स प्रदर्शित केलेले आहेत, जे वैद्यकीय न्यायशास्त्र, फॉरेन्सिक मेडिसिन आणि टॉक्सिकोलॉजी या विषयांचे विविध पैलू MSR (Minimum Standard Requirements) नुसार दर्शवितात.